Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm379J3QQ19 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm379J3QQ19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms