Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms