Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms