Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lipo1J3QME6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lipo1J3QME6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms