Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms