Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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