Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms