Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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