Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17728E9Q5K2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm17728E9Q5K2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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