Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc175E9PVB3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms