Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde2E9PUP1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms