Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms