Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms