Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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