Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Phf11bB4XVQ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Phf11bB4XVQ1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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