Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6133B2RY53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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