Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap58B2RW38 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms