Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms