Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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