Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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