Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms