Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skint3A7TZF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms