Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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