Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13941A2AJ38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms