Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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