Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms