Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac6Q9Z2V5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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