Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn13Q9Z0S4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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