Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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