Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod3Q9R0E1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms