Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gpc6Q9R087 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gpc6Q9R087 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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