Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms