Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms