Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FancaQ9JL70 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancaQ9JL70 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms