Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms