Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1fQ9JIS7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms