Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms