Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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PmpcaQ9DC61 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PmpcaQ9DC61 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PmpcaQ9DC61 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PmpcaQ9DC61 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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