Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms