Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc91Q9D8L5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms