Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ifi35Q9D8C4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi35Q9D8C4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi35Q9D8C4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms