Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nop56Q9D6Z1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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