Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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