Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc81Q9D5W4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms