Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PudpQ9D5U5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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