Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf128Q9D304 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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