Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mrpl52Q9D0Y8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl52Q9D0Y8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms