Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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