Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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