Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms